Sistem air merusak pencemaran air pedesaan terutama disebabkan oleh limbah industri, limbah pertanian, dan limbah kehidupan." Selain itu, banjir besar di pedesaan mencakup sungai-sungai yang meluap, danau-danau yang menyusut, danau-danau yang menyusut, oasis alam, waduk yang surut, dan permukaan air bawah tanah.